劇情大綱：為了檢、警職權的歸屬，檢察機關和警察機關召開協商會，黃始木（曹承佑飾演）因此被調回首爾的大檢察廳成為協商會的一員，卻也在此見到以前一起查案的韓汝珍（裴斗娜飾演）和張健（崔載雄飾演），只是再次見面的他們卻站在對立的立場，究竟他們會以何為優先？
發現看秘密森林這系列的戲會自動放棄跟隨劇情動腦推理，因為戲中角色人物的互動和反應就已經佔據大部分的視線和腦力，尤其這一季中有很多談判的戲，每次看這些談判的場面就覺得很過癮。
再次佩服黃始木檢察官始終如一的精神和原則，不論是吃飯，還是睡覺，只要是上司或是前輩的一通電話就立即出動，面對上司或前輩不合理的行為，也是不客氣地會嗆回去，但該閉嘴的時候還是會自動閉嘴，不會一直喋喋不休地說個不停，重點是即使他閉嘴了，該做的事、該查的案件，不論上司或前輩如何威逼利誘或軟硬兼施，他始終不會放棄自己的原則和立場，該辦就辦，雖然看似得罪不少人，卻也還是有人在支持著他。在這部戲中也可看到永恩秀到底在他心中占有何種位置？在第一季中，他看似對永恩秀很冷淡，但其實他是試圖保護著她，且永恩秀的死對他的衝擊最大，所以在這一季中，當他看到另一個女檢察官時，感覺他對她好一些了，因為他從那位女檢察官身上看到永恩秀的影子，只要那位女檢察官有想要跟他討論的案件或看法，他都不會拒絕，甚至學會小小的稱讚她，藉此鼓勵她。
而韓汝珍雖然跟黃始木保持友誼，但一開始她是偏向警察的立場，依照上司崔炳（田慧振飾演）的命令，將黃始木所提供給她的資訊，利用為可以攻擊檢察機關的戰略，或是事先調查以便進行防禦，也許她並無惡意，即使黃始木發現了她的行為，只要不是影響案情，黃始木基本上也沒說什麼，相較之下，對於上司要求黃始木利用與韓汝珍的交情去探聽消息，原本猶豫的黃始木，最終還是沒向韓汝珍開口，反而自己去調查出來，這也是後來韓汝珍會覺得對黃始木有愧疚，後續在查案時，兩人又恢復之前的情誼，以案件和被害人的安全為優先考量，努力合作查案。看他們兩人真心合作，共同努力查案的樣子還是最好看的，甚至於黃始木為了維護韓汝珍，還跑去跟崔炳談判。在這部戲中看到了黃始木終於憤怒的一面，也看到他會維護別人，甚至也能開心的笑出來，黃始木在這部戲中終於顯露出他的情感了。而韓汝珍因為查出上司的罪被所有情報組的人鄙視，最後是否能因新的上司而有所翻轉呢？
韓汝珍曾經因為上司崔炳的命令，而掩護政治人物的兒子吸毒的事情，卻因此成為被黃始木的上司禹太夏威脅的把柄。韓汝珍的上司崔炳也是因為上司的命令而幫禹太夏掩護被招待還有棄屍的罪，變成需與禹太夏配合。黃始木之前的上司姜元哲放棄了自己的原則，誤信吳柱善的話，反而被要脅。整部戲明面上是檢方與警方互相爭權為基礎的戲，但實際上可以看到只要沒有堅守自己的立場和原則，哪怕只是原則最微小的退讓，最終成就的都是別人，受傷的卻永遠是自己。除了上述的例子，還有戲中一直在探討那組收賄的警察，到底有沒有殺死想要爆料的同事？其中那個白組長雖然沒有拿錢，卻也是破壞了自己原則的人，因為沒有固守住原則，只要有發生事情，他就是會不斷的被傳喚和被懷疑，就算他最後發現自己沒有一開始就堅守原則是錯誤的，傷害終究是造成了，且會一直跟著他。
在第一季中雖然覺得徐東載（李浚赫飾演）實在是太牆頭草，但第二季的戲比第一季更過分，每次看到他那油得不行的嘴臉，真的是會讓人火冒三丈。可是他還是發現了一些有貓膩的案件，也證明他其實是有本事的檢察官，只是他太在意升遷，不像黃始木安於做好自己的工作，其實徐東載跟黃始木也是個對照，一個是腳踏實地不求名聲和升官的檢察官，這些反而自動送上門；一個是汲汲營營於追求名聲和升官的檢察官，卻被人呼來喚去，成為被利用的棋子。到底最後這兩人的對照會延續到何時？蠻讓人有想像空間。
在上一季中看似優雅、力挺丈夫的檢察官夫人李妍在（尹世雅飾演），在這一季卻成為善於謀略和有野心的企業家，而她身旁那個忠心耿耿的朴常務是否也喜歡著她呢？感覺這一季比第一季留下更多的開放結局呢。
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